ขนาดและประเภทของสิ่งมีชีวิต : ในทางทฤษฎีรังสีรังสียูวีสามารถฆ่าไวรัสแบคทีเรียสาหร่ายและโปรโตซัว โดยทั่วไปสิ่งมีชีวิตขนาดใหญ่เช่นโปรโตซัวต้องใช้รังสี UV ในปริมาณที่สูงกว่าสิ่งมีชีวิตเช่นแบคทีเรีย แต่ยังมีความแตกต่างระหว่างสิ่งมีชีวิตชนิดต่าง ๆ ประเภทเดียวกัน: แบคทีเรียบางชนิดมีความต้านทานต่อรังสีอัลตราไวโอเลตอื่น ๆ
พลังของหลอดไฟ : ปริมาณแสง UV ที่เกิดจากหลอดไฟสะท้อนอยู่ในวัตต์ของหลอดไฟ โคมไฟที่มีวัตต์สูงกว่าจะให้แสงอัลตราไวโอเลตมากขึ้น ความสามารถของหลอดฟลูออเรสเซนต์ในเชื้อโรคในการผลิตแสง UV ลดลงตามอายุและในกรณีส่วนใหญ่หลอดต้องถูกแทนที่ทุก 6 เดือน แสง UV ผลิตได้ดีที่สุดที่อุณหภูมิ104-110ºF; ตัวทำความเย็นจะส่งผลน้อยลง การเจาะรังสียูวี : หากแสง UV ไม่สามารถเจาะน้ำได้ก็จะไม่มีประสิทธิภาพ ความขุ่นของน้ำที่สูงขึ้นจะลดการเจาะ
สารฆ่าเชื้อ UV ควรวางไว้หลังจากตัวกรองชีวภาพและเครื่องจักรกลเพื่อให้น้ำชัดเจนที่สุดเท่าที่จะเป็นไปได้เมื่อเข้าสู่การฆ่าเชื้อ ความเค็มยังส่งผลกระทบต่อการรุก แสง UV แทรกซึมน้ำจืดได้ดีกว่าน้ำเค็ม ในที่สุดความสะอาดของหลอดไฟหรือแขนเสื้อเป็นสิ่งสำคัญ หากมีการฝากฟิล์มหรือแร่ธาตุครอบคลุมโคมไฟหรือแขนเสื้อแสงจะถูกบล็อกบางส่วนหรือทั้งหมด ระยะทางของหลอดไฟจากน้ำก็มีผลต่อประสิทธิภาพ แสง UV จะเจาะน้ำเค็มใสเพียงความลึก 5 มม.

เวลาติดต่อ : ยิ่งระยะเวลาที่น้ำสัมผัสกับแสง UV นานขึ้นก็ยิ่งมีพลังฆ่ามากขึ้นเท่านั้น เวลาติดต่อบางครั้งเรียกว่า "เวลาอยู่" ได้รับอิทธิพลจากอัตราการไหลของน้ำ: อัตราการไหลที่ช้าลงจะเพิ่มเวลาติดต่อ ความยาวของหลอดไฟก็มีผลต่อเวลาติดต่อ; ด้วยหลอดไฟที่ยาวขึ้นน้ำจะสัมผัสกับแสง UV เป็นระยะเวลานาน ตัวแปรอื่นที่ต้องพิจารณาคือเวลาการหมุนเวียน (ระยะเวลาที่ต้องใช้ในการมีปริมาณน้ำทั้งหมดในตู้ปลาผ่านเครื่องฆ่าเชื้อ) เนื่องจากน้ำ "ฆ่าเชื้อ" ผสมกับน้ำในพิพิธภัณฑ์สัตว์น้ำอย่างต่อเนื่องเมื่อมันกลับมาจึงเป็นไปไม่ได้ที่จะ "ฆ่าเชื้อ" น้ำทั้งหมดในพิพิธภัณฑ์สัตว์น้ำ นั่นจะเป็นไปได้ก็ต่อเมื่อน้ำทั้งหมดจะถูกลบออกฆ่าเชื้อแล้วกลับไปที่พิพิธภัณฑ์สัตว์น้ำในครั้งเดียว สิ่งนี้อาจส่งผลให้เกิดน้ำที่ผ่านการฆ่าเชื้อ แต่จะทำให้เกิดความหายนะกับชาวพิพิธภัณฑ์สัตว์น้ำ! การคำนวณเวลาการหมุนเวียนเป็นเรื่องยากทางคณิตศาสตร์ แต่สามารถประมาณด้วยสูตรต่อไปนี้:
9.2 x แกลลอนในถัง = จำนวนชั่วโมงสำหรับการหมุนเวียนหนึ่งครั้ง
อัตราการไหลเป็นแกลลอนต่อชั่วโมง
อุณหภูมิ : แสง UV ผลิตได้ดีที่สุดที่อุณหภูมิ104-110ºF; อุณหภูมิที่เย็นกว่าจะส่งผลให้ผลผลิตน้อยลง แขนเสื้อควอตซ์ช่วยป้องกันหลอดไฟจากน้ำในตู้น้ำเย็นและรักษาเอาต์พุต UV ที่สูงขึ้น